SMK Negeri 2 Balikpapan memiliki program keahlian Teknik Komputer dan Jaringan (TKJ) sejak tahun 2009. Kurikulum yang dilaksanakan di program keahlian TKJ di tahun 2018 ini semua berasal dari Dinas Pendidikan yang mengacu pada SKKNI. Mata pelajaran yang dilalui siswa TKJ bervariasi mulai dari Jaringan Dasar hingga Administrasi Server dalam Jaringan.

Dalam era persaingan global persaingan untuk mendapat pekerjaan maupun melanjutkan studi ke universitas ternama akan semakin sulit. Untuk mengatasi hal tersebut, pihak sekolah perlu lebih ‘kreatif’ lagi agar bisa mencetak lulusan lebih berkualitas dari sekolah lain agar bisa diterima di perusahaan atau universitas ternama. mengadakan pelatihan atau sertifikasi untuk siswa merupakan salah satu cara untuk meningkatkan kualitas lulusan di SMKN 2 Balikpapan sehingga lulusan sekolah ini bisa lebih baik dari sekolah lain.

MikroTik Academy adalah sebuah program yang disiapkan untuk jalur pendidikan, yaitu Politeknik / universitas / sekolah kejuruan dan sejenisnya untuk mepelajari MikroTik. Kelas MikroTik akan banyak menggunakan LAB-Komputer layaknya pelatihan atau sertifikasi dan akan terdapat ujian untuk mengukur seberapa jauh kemampuan yang di miliki siswa. Tujuan dari MikroTik Academy adalah sekolah dapat mengadopsi kurikulum MTCNA kedalam kegiatan belajar mengajar serta memberi nilai tambah bagi Sekolah dan bila disetujui Sekolah dapat mengadakan Sertifikasi Internasional.

Pada tanggal 16 sampai 18 November 2016, SMK Negeri 2 Balikpapan telah mengirim dua guru TKJ bernama Masnur, S.Kom dan Usman Sabar Nasution, S.Pd untuk mengikuti training dan sertifikasi MTCNA di Balikpapan. Guru yang kami ikutkan training dan sertifikasi tersebut telah lulus ujian MTCNA. Pada tahun 2018 guru kami ada yang lulus MTCRE dengan nilai 76. Dengan begitu maka Bapak Masnur, S.Kom berhak untuk menjadi trainer MTCNA di SMK Negeri 2 Balikpapan dan mendirikan MikroTik Academy.

Seluruh siswa Program Keahlian Teknik Komputer dan Jaringan akan diikutkan dalam training dan sertifikasi MTCNA sebelum kelulusan. Seluruh siswa tersebut akan dilatih terlebih dahulu selama 3 hari dengan materi-materi dari MTCNA Outline. Setelah menjalani training selama 3 hari, seluruh siswa akan diikutkan ujian MTCNA atau MTCNA Exam dan bagi siswa yang lulus akan mendapat Sertifikat Internasional MTCNA.